在項目管理軟件中，系統管理主要用于后臺管理軟件的基本數據配置，包括：建立公司組織結構、建立公司崗位、配置軟件操作權限、配置數據權限、管理公司員工賬戶、管理公司標志、后臺刪除數據、查看系統運行日志等。

　　一般情況下，系統管理需要管理員權限，其他人無權限則看不見。

　　組織機構可以構建公司的組織機構框架，當公司的組織結構調整后，軟件中的組織機構框架可以同步調整。

　　參數配置主要用于配置業務參數代碼、業務參數名稱、業務參數值等。

　　崗位管理用于建立公司所有崗位，并根據上下級關系對這些崗位進行排序，方便上下級之間的工作流程、工作日志、計劃總結等數據自動流通。

　　用戶管理使用后臺管理公司全體員工的賬戶信息，可進行新員工賬戶、修改員工賬戶等操作。

　　委托管理可以委托設置流程審批，以滿足流程審批人因特殊原因無法在線審批流程的需要。此功能可以查閱和修改協同辦公室所有者的流程委托設置。

　　功能權限可配置多個不同層次的軟件操作權限，滿足公司不同層次、不同崗位員工對軟件個性化權限的需求，功能權限可配置個人辦公或我的消息等整體模塊的操作權限，也可配置公司新聞中發布新聞等具體應用的操作權限。

　　數據權限用于實現非上下級之間的數據訪問權限。崗位層面只能解決上下級之間的數據訪問權限，而數據權限則填補了上下級之外的權限空白。目前需要配置數據權限的業務有工作日志和計劃總結。

　　數據管理用于后臺刪除所有信息、新聞、通知和文件。

　　系統日志用于查詢和管理系統運行歷史記錄。

　　菜單配置用于配置各級菜單的名稱和排序。

　　表單注冊和表單注冊主要用于自定義表單的配置和維護。

　　固定表的標題主要用于定制固定表的表頭名稱。

　　打印管理主要用于配置各業務表單的打印模板。

　　報銷配置主要用于配置報銷相關表單的費用類型和法人單位。